DNAMAN是一分子生物學軟體. 本軟體提供了非常的功能,可以有很有效率的做定序分析. 您不需要買一堆軟體,在DNAMAN您可一次做完所有的分析如多維定序對齊(Multiple sequence alignment),設計PCR primers,限制分析(restriction analysis), 蛋白質定序分析(protein sequence analysis)和畫質體等(Plasmids)… DNAMAN可以為您執行以上所有的工作..
定序操作(Sequence manipulation)
DNAMAN提供20餘種定序管道,大幅提高定序的效率
定序搜尋
DNAMAN可讓您從單一或雙條DNA中以核酸定序搜尋
限制分析
您可以在DNA定序中搜尋任何限制區(Restriction site)
DNAMAN提供兩種限制酵素檔,並有180多種常用的酵素
定序排列
DNAMAN採用快速的排列演算法,,使排列的結果更快更準,,並可處理大量重疊的定序
同源(Homology)比較
使用DNAMAN您可以在矩陣圖(Dot matrix plot內比較兩組DNA定序或兩組蛋白質定序).
多重定序排列
DNAMAN使用Wilbu及Lipman演算法做快速排列.而Feng-Doolittle及Thompson(CLUSTAL)演算法則用於最佳化定序排列
源生素(Primer)/醣類(Oligo)分析
Primer的設計不只包函Tm的primer filtration,也包含了mispriming及限制分析. DNAMAN可以協助您找出最佳的primers以滿足您的需求.
蛋白質分析Protein analysis
DNAMAN可讀三種Frame的DNA,`並會推算出蛋白質定序,並有多種顯示方式
資料庫管理
可管理1.Oligo 2.DNA 3.蛋白質資料庫.
可以在DNA及蛋白質資料庫內搜尋資料
繪圖工具LBDraw
設計給分子生物學家使用
可與DNAMAN搭配使用
Lynnon Biosoft和銷售生物資訊學軟體平臺，用於教育，研究和開發令人興奮的基因組科學世界。我們的產品DNAMAN軟體包為序列分析和數據挖掘提供了一個有效的工具包。
什麼DNAMAN
DNAMAN 是用於分子生物學應用的一體式軟體包。該套件提供了一個具有多功能功能的集成系統，可實現高效的序列分析。您不再需要一個程序進行限制性分析，而其他程式用於多個序列比對、設計PCR引物、蛋白質序列分析或繪製質粒…… DNAMAN為您執行所有這些任務。
DNAMAN的速度，多功能性，準確性和高品質的演示使其成為每個分子生物學家可以依賴的基本工具之一。DNAMAN是眾多同行評審科學期刊上高度引用的序列分析軟體。它也是一個序列分析軟體包，價格實惠，適用於每所大學，研究機構，實驗室和研究科學家。
《DNAMAN》適用於Microsoft Windows、OSX和Linux。所有三個平臺上的DNAMAN檔共用相同的格式。DNAMAN 的通用格式系統促進了視窗、Mac OSX 和 Linux 之間的通信，使您的工作獨立於平臺。
亮點
發佈DNAMAN版本 10
綠色承諾：DNAMAN 實現無紙化 – 所有軟體產品均通過網路交付
提供學生價
發佈用於Linux的DNAMAN
發佈用於 Mac OSX 的DNAMAN
DNAMAN 序列分析功能簡介
集成系統
WINDOWS、OSX 和 Linux 上的 DNAMAN 桌面
序列操作
序列輸入
DNAMAN 序列是使用關鍵字格式化的純文字檔。該程式接受其他常見的序列格式，如GenBank、GCG、CUSTAL、FASTA、PIR 和 GDE。DNAMAN 利用序列通道將活動序列保存在記憶體中以實現快速計算。資料庫也可用於幫助組織特定研究專案的序列。所有三個序列輸入介面均可在DNAMAN Desktop上訪問。
序列組成和轉換
NAMAN使用簡單的下拉功能表命令報告序列組成和分子量。它可以將序列轉換為其反向，互補，反向互補，雙鏈和RNA序列。
序列搜索
DNAMAN提供序列搜索和比較工具，包括核苷酸或氨基酸序列，共識序列，開放閱讀框，重複序列。小干擾RNA（siRNA）選擇工具可用於提高siRNA設計的品質。用戶可以對 NCBI 資料庫或 DNAMAN 程式中其他基於網路的序列伺服器執行 BLAST 搜尋。
限制性分析
DNAMAN 為DNA序列的限制性分析提供了直觀的介面。結果可以顯示為文本，限制性圖譜和限制性圖案（Agarose gel）。其他工具包括Electronic Cloning，從片段重建限制圖，沉默突變和定向不匹配。
序列組裝
DNAMAN使用快速準確的比對演算法來組裝大量序列。跟蹤檔可以直接用於組裝。SNP可以通過組裝的序列集進行驗證。
同源性比較
點陣圖
可以使用點圖在DNAMAN中分析大序列的同源區域。感興趣的序列區域可以
兩個序列對齊
DNAMAN 提供了許多快速或最佳化的演算法來對齊兩個DNA或蛋白質序列。
多序列比對
DNAMAN使用ClustalW演算法（Feng-Doolittle 和 Thompson）進行最佳對準，並使用全域對齊演算法（Wilbur 和 Lipman）進行快速對齊。DNAMAN 中的三種類型的最佳比對可提供高品質的比對結果。使用快速比對方法，您可以快速對齊大量DNA或蛋白質序列。可以在「多對齊序列編輯器」中進一步修改或調整對齊。
系統發育分析
DNAMAN使用通用演算法來計算同源矩陣，並在所有序列對之間建立相關距離。它可以產生距離矩陣，並從多個對齊中繪製系統發育樹或同源樹。自舉分析可用於系統發育樹的置信度值。
Primer/Oligo分析
PCR Primer設計
DNAMAN 為 PCR 引物選擇提供了多種對照標準。您可以通過設置目標DNA的區域、PCR產物的大小、引物特性、反應條件和引物配置來最佳化引物過濾。
其他功能
可以分析寡核苷酸引物的解鏈溫度、互補性、錯誤引物、沉默突變和定向錯配。
Protein分析
DNAMAN為蛋白質序列分析提供了許多工具，包括從兩個DNA鏈中翻譯所有六個閱讀框，遺傳密碼表的變化，閱讀框架概述，密碼子使用分析，氨基酸組成，親水譜，電荷和pI分析，二級結構預測和反向翻譯。
資料庫管理
DNAMAN 使用標準關係資料庫引擎 Sqlite3 來管理 DNA/蛋白質序列和寡核苷酸序列。
LBDraw（僅限 Windows）
On the Internet (僅限 Windows)
DNAMAN可以處理的最大序列是什麼？
從理論上講，DNAMAN可以處理高達2千兆鹼基（2×109）的序列。真正的限制是電腦能力和資源。我們已經用10兆鹼基的序列測試了該程式，用於限制分析和序列搜索。多重比準和序列裝配的功能在序列處理中具有不同的限制。
多重對齊有什麼限制？
最多可以使用 32000 個序列，最大長度為 64000 個鹼基。同樣，限制是電腦的能力資源。我們已經成功地將大約300個氨基酸的1000個序列與該程式對齊。
序列組裝有哪些局限性？
您可以使用多達32000個DNA片段，最大長度為1千兆鹼基。同樣，限制是電腦的能力和資源。我們已經成功地用這個項目組裝了5000個序列，大約2000個鹼基。
DNAMAN簡介中文
DNAMAN簡介英文
